- Épisode 1 : Prise au piège
- Épisode 2 : La Vie d’une autre
- Épisode 3 : Transfert d’identité
- Épisode 4 : L’Infiltrée
- Épisode 5 : Prison dorée
- Épisode 6 : Fréquence pirate
- Épisode 7 : Candy Man
- Épisode 8 : Le Retour
- Épisode 9 : Le Marionnettiste
- Épisode 10 : Réactions en chaîne
- Épisode 11 : De l’homme à la machine
- Épisode 12 : Questions et Réponses
- Épisode 13 : Renaissance
- Épisode 14 : Appartement 6B
- Épisode 15 : Sujet n°13
- Épisode 16 : Le Rêve d’Icare
- Épisode 17 : Passager clandestin
- Épisode 18 : La Lignée
- Épisode 19 : Qui veut la peau d’Olivia Dunham ?
- Épisode 20 : Résonances
- Épisode 21 : Sam Weiss, dernier du nom
- Épisode 22 : Le Jour de notre mort
